随着时代变迁，博物馆的功能逐渐从单纯的文物及自然史展示，转向更重视地方文化保存、城市历史及市民生活记忆的方向。
民国107年2018年9月3日，嘉义市立博物馆正式闭馆，开始进行馆史上规模较大的展示更新工程。
此次更新不只是重新装修展览空间，更重要的是重新思考博物馆与城市之间的关系，希望让博物馆成为介绍嘉义、认识嘉义的重要文化入口。
在这次转型过程中，博物馆重新确立了「嘉义人关心嘉义事，异乡人探索嘉义市」的宗旨，将展示主题从原本以地质、化石及美术为主的内容，扩展至嘉义市的历史、产业、自然环境、生活文化及传统工艺。
经过两年多的整修与展示更新，嘉义市立博物馆於民国110年2021年1月23日重新开馆，以全新的展示内容与空间设计和民众见面。
重新开馆後，博物馆采取分楼层展示的方式，让不同年龄层的参观者都能找到适合自己的学习内容。
一楼规划「探索嘉园」儿童厅，透过游戏及互动体验，让小朋友认识嘉义的历史与城市文化；二楼设置「展望诸罗」常设展，以不同主题介绍嘉义的历史发展、产业、自然环境及艺术人文；三楼则设置交趾陶馆，以馆中馆的形式呈现嘉义具有代表性的传统工艺。
嘉义市立博物馆成立的主要目的，是希望透过文物典藏、研究展示、文化保存及教育推广等方式，保存嘉义的地方记忆，让市民更加认识自己的家乡，也让外地游客能够从博物馆出发，深入了解嘉义这座城市。
因此，嘉义市立博物馆的发展，不仅呈现了博物馆从自然史展示转型为城市博物馆的过程，也反映出地方文化保存及城市认同的重要性。
二、博物馆值得一说的特别之处
嘉义市立博物馆与一般以单一主题为主的博物馆不同，它最大的特色在於以整座城市作为展示主体，将嘉义的历史、自然环境、产业发展、艺术文化及传统工艺融入展览之中，具有以下几项值得介绍的特色。
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